RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532581.5

GRAMD1B-208, Transcript of GRAM domain containing 1B, human

TSL 2

Gene GRAMD1B, Length 2,615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DGKA	P23743	735 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RAD23A	P54725	363 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HMGCS1	Q01581	520 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TWF1	Q12792	350 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR52E6	Q96RD3	313 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	EGFL8	Q99944	293 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KL	Q9UEF7	1012 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CLDN25	C9JDP6	229 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SEC22B	O75396	215 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	EBLN1	P0CF75	366 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CTGF	P29279	349 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CCR3	P51677	355 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OCA2	Q04671	838 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PIGF	Q07326	219 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF846	Q147U1	533 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CTF1	Q16619	201 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ARL10	Q8N8L6	244 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	EID2B	Q96D98	161 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NTMT1	Q9BV86	223 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SELENON	Q9NZV5	590 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LHX3	Q9UBR4	397 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MANBA	O00462	879 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	BCKDK	O14874	412 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	UGT2B11	O75310	529 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GJB5	O95377	273 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SERPINA1	P01009	418 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KLKB1	P03952	638 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OPRL1	P41146	370 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PIK3CG	P48736	1102 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TRIM32	Q13049	653 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ITGAD	Q13349	1161 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	USP7	Q93009	1102 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	APOL5	Q9BWW9	433 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HMG20A	Q9NP66	347 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	C1orf109	Q9NX04	203 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581		A0A096LPI6	279 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581		M0QX08	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NDUFS2	O75306	463 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SERPINB7	O75635	380 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ARHGEF15	O94989	841 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	INMT	O95050	263 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PRAMEF1	O95521	474 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	UGT2B4	P06133	528 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CKB	P12277	381 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FUT4	P22083	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CDH3	P22223	829 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GZMM	P51124	257 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	VAC14	Q08AM6	782 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ACOX1	Q15067	660 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PHKG1	Q16816	387 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GTDC1	Q4AE62	458 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LINGO4	Q6UY18	593 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FRS2	Q8WU20	508 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PYURF	Q96I23	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KCNH6	Q9H252	994 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	XYLB	O75191	536 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GRAMD1B-208	ENST00000532581	STC2	O76061	302 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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