RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528250.1

EED-208, Transcript of embryonic ectoderm development, human

TSL 2

Gene EED, Length 1,235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EED-208	ENST00000528250	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ALG14	Q96F25	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	FEV	Q99581	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	STK26	Q9P289	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ACSL3	O95573	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	SCG2	P13521	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	EPHA2	P29317	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	SLC6A6	P31641	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	DLX5	P56178	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	DHX58	Q96C10	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	MYADM	Q96S97	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	FZD8	Q9H461	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CCDC188	H7C350	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CLDN4	O14493	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CRYAA	P02489	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	NR3C1	P04150	777 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	GP5	P40197	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	LHX1	P48742	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	NR2C2	P49116	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ASCL1	P50553	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	EXT2	Q93063	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CLIC2	O15247	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	FGF5	P12034	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	HOXC8	P31273	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	PTGER4	P35408	488 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	DCT	P40126	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	UBASH3A	P57075	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CA9	Q16790	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EED-208	ENST00000528250	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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