RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMPRSS3P57727 454 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SSTP61278 116 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 GHRHRQ02643 423 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 LCP2Q13094 533 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 PDE7AQ13946 482 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 GIT2Q14161 759 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 OASLQ15646 514 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACKR1Q16570 336 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 CTF1Q16619 201 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 C18orf63Q68DL7 685 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 IRGCQ6NXR0 463 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM122CQ6P4D5 195 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM71Q6P5X7 295 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 CYB5D1Q6P9G0 228 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARSKQ6UWY0 536 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 B3GLCTQ6Y288 498 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 Q6YL49 198 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF793Q6ZN11 406 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SYVN1Q86TM6 617 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 NUDT13Q86X67 352 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADGRG3Q86Y34 549 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SERPINA12Q8IW75 414 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 BEST3Q8N1M1 668 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 RDM1Q8NG50 284 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SHC3Q92529 594 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SARAFQ96BY9 339 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 LINGO1Q96FE5 620 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 PGM2Q96G03 612 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRAMD2BQ96HH9 432 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SH2D3AQ9BRG2 576 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 C16orf70Q9BSU1 422 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 DUSP26Q9BV47 211 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 MLST8Q9BVC4 326 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TPPP3Q9BW30 176 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRRG4Q9BZD6 226 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 P2RY12Q9H244 342 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 DPAGT1Q9H3H5 408 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 MLXIPLQ9NP71 852 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPR173Q9NS66 373 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMOD2Q9NZR1 351 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNPEPQ9ULA0 475 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 LOXL2Q9Y4K0 774 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 YIPF1Q9Y548 306 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM191CA6NGB0 347 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM221A6NGB7 291 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRRC3CA6NJW4 275 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRR32B1ATL7 298 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 B4DGG1 531 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM150CB9EJG8 249 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 I3L1I5 382 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 K7ESM1 405 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 E2F3O00716 465 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 MDM4O15151 490 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZIC3O60481 467 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR6A2O95222 327 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TGFAP01135 160 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 IFNA2P01563 188 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 TPBGLP0DKB5 382 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 IRF2P14316 349 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHRNB2P17787 502 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 PSMB4P28070 264 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP3CCP48454 512 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 MTTPP55157 894 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZP1P60852 638 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 ID2Q02363 134 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 EGR4Q05215 589 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 IL10RBQ08334 325 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 CETN1Q12798 172 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 NPTX1Q15818 432 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBBP7Q16576 425 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 SMTNL2Q2TAL5 461 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 Q5PR19 223 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATAD3BQ5T9A4 648 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR6B2Q6IFH4 312 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-928P-201ENST00000516876 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms