RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 PIPSLA2A3N6 862 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM149AA5PLN7 773 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 TLCD2A6NGC4 264 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 RASSF9O75901 435 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf105O95561 183 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP2A7P20853 494 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 GABRB3P28472 473 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFRSF8P28908 595 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 GPX6P59796 221 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 PRKG2Q13237 762 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 SP140Q13342 867 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CAMK2BQ13554 666 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 KYNUQ16719 465 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 IRGCQ6NXR0 463 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 PPM1NQ8N819 430 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CD200R1Q8TD46 325 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 TGM7Q96PF1 710 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 FUT8Q9BYC5 575 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 NFU1Q9UMS0 254 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 B4E171 279 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 RASGRF2O14827 1237 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ITGA2BP08514 1039 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ABHD2P08910 425 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 FDXRP22570 491 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CNTFP26441 200 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CD82P27701 267 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPAN7P41732 249 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINB9P50453 376 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 GABREP78334 506 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKS6Q68DC2 871 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 VRK3Q8IV63 474 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ASB11Q8WXH4 323 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 NDNQ99608 321 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 RBBP8Q99708 897 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 OGFRQ9NZT2 677 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC189A1A4V9 331 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 GSAPA4D1B5 854 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 INHBAP08476 426 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 STMN1P16949 149 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 SPINK2P20155 84 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH3P22223 829 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CRABP2P29373 138 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CSF2RBP32927 897 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC26A3P40879 764 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 PMS2P54278 862 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 AP1S2P56377 157 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 RP1P56715 2156 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ACY1Q03154 408 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 IL11RAQ14626 422 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 OR8K5Q8NH50 307 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 ATL1Q8WXF7 558 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 RSC1A1Q92681 617 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM136AQ96C01 138 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms