RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 SPASTQ9UBP0 616 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TECTAO75443 2155 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CASC3O15234 703 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 OGTO15294 1046 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 B4GALT5O43286 388 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CYTIPO60759 359 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 USP12O75317 370 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT37O76014 449 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MLYCDO95822 493 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PDGFAP04085 211 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 OR4E1P0C645 316 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB3AP20336 220 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PDCP20941 246 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL5P46777 297 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GRM2Q14416 872 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ADIPOQQ15848 244 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM16LQ309B1 348 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf27AQ580R0 203 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TOR2AQ5JU69 321 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR158Q5T848 1215 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 STEAP3Q658P3 488 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 KCTD11Q693B1 232 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf94Q6P1W5 598 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP28Q8NHY6 868 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 THRSPQ92748 146 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 HAS1Q92839 578 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MFSD3Q96ES6 412 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SUSD3Q96L08 255 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FOPNLQ96NB1 174 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DUSP26Q9BV47 211 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX24Q9Y343 169 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 POTEMA6NI47 508 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 EVPLLA8MZ36 301 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC16A6O15403 523 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHGA12O60330 932 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 HUS1O60921 280 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 AKAP3O75969 853 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 UBOX5O94941 541 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 STBD1O95210 358 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 IL18RAPO95256 599 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNE1P15382 129 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 IL11P20809 199 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CHMP24386 653 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 LCN1P31025 176 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CSNK1DP48730 415 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CCR5P51681 352 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RBP5P82980 135 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKAA1Q13131 559 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ST3GAL2Q16842 350 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNTL6Q49A17 601 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PLA1AQ53H76 456 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 Q5PR19 223 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CES4AQ5XG92 561 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNT18Q6P9A2 607 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 POTEGQ6S5H5 508 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TRILQ7L0X0 811 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CATSPER3Q86XQ3 398 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SFRP1Q8N474 314 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 OR52H1Q8NGJ2 320 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 AKR7LQ8NHP1 331 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms