RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	MED13	Q9UHV7	2174 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PIPSL	A2A3N6	862 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307		E7EVH7	732 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KDM1A	O60341	852 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RFPL1	O75677	317 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CEACAM4	O75871	244 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	FKBP9	O95302	570 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ONECUT2	O95948	504 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	NTRK1	P04629	796 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	HBQ1	P09105	142 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ETS1	P14921	441 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ARNT	P27540	789 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	AOAH	P28039	575 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CCR7	P32248	378 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	NPY2R	P49146	381 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TTPA	P49638	278 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CCZ1B	P86790	482 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNC4	Q03721	635 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	GRB7	Q14451	532 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	GBX1	Q14549	363 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KIR2DS3	Q14952	304 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	NRTN	Q99748	197 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ASF1A	Q9Y294	204 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A0J9YY10	115 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	GSAP	A4D1B5	854 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	FGG	P02679	453 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	UGT2B7	P16662	529 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PKLR	P30613	574 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RAB28	P51157	221 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ITGA1	P56199	1179 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	FOXK1	P85037	733 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ZIC1	Q15915	447 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TCF12	Q99081	682 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307		E7EQ34	232 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	MAP3K7	O43318	606 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KATNA1	O75449	491 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RPN2	P04844	631 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ATP5D	P30049	168 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CD97	P48960	835 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	LMAN1	P49257	510 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PRAME	P78395	509 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	NFKB2	Q00653	900 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TLE1	Q04724	770 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KLRB1	Q12918	225 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PRKG2	Q13237	762 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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