RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	CA14	Q9ULX7	337 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	LRP4	O75096	1905 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	KMO	O15229	486 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	EBLN1	P0CF75	366 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	LBP	P18428	481 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ITPKA	P23677	461 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM23	P36406	574 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	HTR6	P50406	440 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP4B	P51164	291 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	TPMT	P51580	245 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	STX1B	P61266	288 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CUL3	Q13618	768 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	HERC3	Q15034	1050 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM69	Q86WT6	500 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	FLCN	Q8NFG4	579 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO27	Q8NI29	283 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ATL1	Q8WXF7	558 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	NTMT1	Q9BV86	223 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SZT2	Q5T011	3432 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC31A1	O15431	190 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RASSF9	O75901	435 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	C1orf105	O95561	183 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PRR35	P0CG20	571 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	THRA	P10827	490 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	EPOR	P19235	508 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	MNAT1	P51948	309 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RPA4	Q13156	261 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC32	Q14392	662 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	GRB7	Q14451	532 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	KIF19	Q2TAC6	998 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	OGFOD2	Q6N063	350 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2T11	Q8NH01	316 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PKP4	Q99569	1192 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CCT7	Q99832	543 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	APOO	Q9BUR5	198 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	KL	Q9UEF7	1012 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL33	A6NCF5	533 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC72	A6NJI9	287 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	FFAR3	O14843	346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	GSC2	O15499	205 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR42	O15529	346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT34	O76011	436 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CLDN9	O95484	217 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CHRNB1	P11230	501 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ACP5	P13686	325 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ACADL	P28330	430 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	IMPA1	P29218	277 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ACSL1	P33121	698 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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