RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GPC2	Q8N158	579 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	STON2	Q8WXE9	905 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PIK3R3	Q92569	461 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AIG1	Q9NVV5	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	C3orf18	Q9UK00	162 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM25A	B3EWG3	89 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM25C	B3EWG5	89 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM25G	B3EWG6	89 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	KERA	O60938	352 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MATN4	O95460	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NDST3	O95803	873 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MLYCD	O95822	493 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FGF4	P08620	206 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MTHFD2	P13995	350 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	HTR1B	P28222	390 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FMO3	P31513	532 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ACVRL1	P37023	503 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	IL2	P60568	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FOXM1	Q08050	763 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	RCAN2	Q14206	197 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DSC3	Q14574	896 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GDF15	Q99988	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM234B	A2RU67	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PRKD3	O94806	890 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PTTG1	O95997	202 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PRL	P01236	227 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FDXR	P22570	491 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC26A3	P40879	764 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	VBP1	P61758	197 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SNTA1	Q13424	505 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SMIM14	Q96QK8	99 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DPY30	Q9C005	99 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	RASSF1	Q9NS23	344 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A0U1RQS6	177 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	HHLA1	C9JL84	531 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157		H0YAE9	185 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	LDB2	O43679	373 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	DFNA5	O60443	496 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	HRH2	P25021	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	SEPHS1	P49903	392 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	TWF1	Q12792	350 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PTGR1	Q14914	329 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	CCL15	Q16663	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157		Q5BKY6	102 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	USP51	Q70EK9	711 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR142	Q7Z601	462 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	BTBD2	Q9BX70	525 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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