RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 HYAL2Q12891 473 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF384Q8TF68 577 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 FATE1Q969F0 183 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 IFT27Q9BW83 186 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 CLDND1Q9NY35 253 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 WNT9AO14904 365 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 PCDH7O60245 1069 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 CREB5Q02930 508 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 HAPLN3Q96S86 360 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 ADAMDEC1O15204 470 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 32.1
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PTPRF-209ENST00000438120 MBLAC2Q68D91 279 aa16.87■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 OR2L5Q8NG80 312 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 HM13Q8TCT9 377 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.87■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 SMCO1Q147U7 214 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 Q6ZVU0 165 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 MBD2Q9UBB5 411 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 K7EPI3 171 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 ITM2AO43736 263 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 CFIP05156 583 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 C5orf22Q49AR2 442 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 IFI44LQ53G44 452 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 OR4C6Q8NH72 309 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 NPY5RQ15761 445 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 USP30Q70CQ3 517 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 PIM3Q86V86 326 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 FCRL5Q96RD9 977 aa16.86■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 TMEM145Q8NBT3 493 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 ROPN1LQ96C74 230 aa16.86■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 PI15O43692 258 aa16.86■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.86■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 AGPSO00116 658 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 PLK4O00444 970 aa16.85■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 NFATC2Q13469 925 aa16.85■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 GRHL3Q8TE85 626 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 A0A0J9YVX5 310 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PRB8 838 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 GPIP06744 558 aa16.85■□□□□ 0.29
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PTPRF-209ENST00000438120 TLCD1Q96CP7 247 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 MALT1Q9UDY8 824 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 FAM172BPA6NC97 362 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 FOXN2P32314 431 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 BDKRB1P46663 353 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 TDRPQ86YL5 185 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM233B4DJY2 109 aa16.85■□□□□ 0.29
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