RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 OVOS1Q6IE37 1185 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SCIMPQ6UWF3 145 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ECHDC3Q96DC8 303 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN17Q96FV3 270 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BOCQ9BWV1 1114 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCSER2Q9H7U1 834 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HPS4Q9NQG7 708 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KCND3Q9UK17 655 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS7Q9Y394 339 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A1O15245 554 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM12O43184 909 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SAT1P21673 171 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT20P35900 424 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HUNKP57058 714 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR17Q13304 367 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MTA1Q13330 715 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRNQ16849 979 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA19Q7Z5L4 167 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CDYL2Q8N8U2 506 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T12Q8NG77 320 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NETO1Q8TDF5 533 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR62Q9BZJ7 368 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZYG11BQ9C0D3 744 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE10AQ9Y233 779 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO16Q9Y6X6 1858 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM247A6NEH6 219 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL15A6NJ78 407 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ESR1P03372 595 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PGRP06401 933 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SSTR4P31391 388 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CRISP3P54108 245 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP2K5Q13163 448 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BFSP2Q13515 415 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LAPTM5Q13571 262 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC190Q86UF4 302 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC43A3Q8NBI5 491 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CHTF18Q8WVB6 975 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK15Q96Q40 435 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM39Q9HCM9 518 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NOD1Q9Y239 953 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN25C9JDP6 229 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TP53P04637 393 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A3P11169 496 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS24P62847 133 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IKZF1Q13422 519 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMK2BQ13554 666 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT8Q16880 541 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS53Q2L4Q9 553 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GGTA1PQ4G0N0 100 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RTP2Q5QGT7 225 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC23Q5W5X9 447 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT80Q6KB66 452 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN19Q8N6F1 224 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7D4Q8NG98 312 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF649Q9BS31 505 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DSN1Q9H410 356 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IL1RL2Q9HB29 575 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OPTCQ9UBM4 332 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM17Q9Y577 477 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A096LPI6 279 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC160A6NGH7 325 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CASTOR2A6NHX0 329 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD66B4E2M5 251 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GIPC1O14908 333 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GAT3O94766 335 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CASP2P42575 452 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NCS1P62166 190 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 COG7P83436 770 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TEKQ02763 1124 aa3.54□□□□□ -1.84
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