RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 EGFP01133 1207 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 GNAZP19086 355 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 CAPN3P20807 821 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ITPKAP23677 461 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 THOP1P52888 689 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PFN3P60673 137 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PSME3P61289 254 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 CEACAM7Q14002 265 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 CCNIQ14094 377 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ADGRE1Q14246 886 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 COL19A1Q14993 1142 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 NR6A1Q15406 480 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF423Q2M1K9 1284 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PNCKQ6P2M8 343 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 CRTC3Q6UUV7 619 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 COX14Q96I36 57 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 TEX37Q96LM6 180 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ACTR8Q9H981 624 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 H3BM21 787 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 MANBAO00462 879 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 VEGFDO43915 354 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 NTSR1P30989 418 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 WSCD2Q2TBF2 565 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 LAYNQ6UX15 382 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF165Q6ZSG1 346 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 RETREG3Q86VR2 466 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 OR2T3Q8NH03 318 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJC11Q9NVH1 559 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 CATP04040 527 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 UFM1P61960 85 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 GRIK2Q13002 908 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PON2Q15165 354 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC6Q16204 474 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 AP5B1Q2VPB7 878 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 USP7Q93009 1102 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC29A3Q9BZD2 475 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC52A3Q9NQ40 469 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 BBIP1A8MTZ0 92 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PRAMEF4O60810 478 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ULK1O75385 1050 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 POP7O75817 140 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 EMX2Q04743 252 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 SGO1Q5FBB7 561 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 DOK6Q6PKX4 331 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF148Q8N7C7 305 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PKP4Q99569 1192 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 GABRG3Q99928 467 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 GPR34Q9UPC5 381 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 NUMA1Q14980 2115 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP5-204ENST00000412806 E7ENX8 843 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC28A1O00337 649 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 RGS14O43566 566 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 ADAM23O75077 832 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 ANP32DO95626 131 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 COL9A1P20849 921 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 CDK3Q00526 305 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 GGTA1PQ4G0N0 100 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 HACD2Q6Y1H2 254 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM46Q7Z4K8 759 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 C11orf96Q7Z7L8 435 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC138Q96M89 665 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 FOPNLQ96NB1 174 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 LGR4Q9BXB1 951 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP10Q9P2G4 905 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 CD207Q9UJ71 328 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP5-204ENST00000412806 PRKAB1Q9Y478 270 aa21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms