RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343060.4

HOXA1-201, Transcript of homeobox A1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1-201ENST00000343060 CCDC190Q86UF4 302 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 OR4L1Q8NH43 312 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 APH1BQ8WW43 257 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 SENP8Q96LD8 212 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 CCDC32Q9BV29 185 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 RNF38Q9H0F5 515 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 C1orf109Q9NX04 203 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ASIC5Q9NY37 505 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 AASSQ9UDR5 926 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 BTN3A1O00481 513 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PTGESO14684 152 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 MED26O95402 600 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 APOA1P02647 267 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 SEMG1P04279 462 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 FPR1P21462 350 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PAX3P23760 479 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 GADD45AP24522 165 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PSMA3P25788 255 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 NR6A1Q15406 480 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 AAK1Q2M2I8 961 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 SMUG1Q53HV7 270 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 MARC1Q5VT66 337 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 MLIPQ5VWP3 458 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 CEP68Q76N32 757 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 SETD6Q8TBK2 473 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 NUDT8Q8WV74 236 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PIK3R3Q92569 461 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ZBTB18Q99592 522 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 OSMRQ99650 979 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ARL5AQ9Y689 179 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 OTOFQ9HC10 1997 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ALOX12P18054 663 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 S100A5P33763 92 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 OR2B6P58173 313 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 GPR50Q13585 617 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 MAPKAPK3Q16644 382 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 SPATC1Q76KD6 591 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 C14orf80Q86SX3 495 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PGBD5Q8N414 524 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 OR2T29Q8NH02 315 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 NETO1Q8TDF5 533 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 HMCESQ96FZ2 354 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 MED30Q96HR3 178 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 CLMPQ9H6B4 373 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 HS3ST4Q9Y661 456 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 U3KQV3 271 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PTPRDP23468 1912 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA1-201ENST00000343060 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 J3KR12 359 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 EPOP01588 193 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 IL6P05231 212 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 CAPN1P07384 714 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 CYP4B1P13584 511 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 PIK3CBP42338 1070 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 GNG2P59768 71 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 PTPRCAPQ14761 206 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 FBXO43Q4G163 708 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HOXA1-201ENST00000343060 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms