RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343017.11

SNX18-202, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

BASIC

Gene SNX18, Length 3,140 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-202ENST00000343017 COL1A2P08123 1366 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 LDB2O43679 373 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 PAGE1O75459 146 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 VIPP01282 170 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 CAPN1P07384 714 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 KCTD2Q14681 263 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 DNASE1L2Q92874 299 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 PCDHGA12O60330 932 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 KERAO60938 352 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ZNF682O95780 498 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 CRYZL1O95825 349 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SLC26A3P40879 764 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 HK3P52790 923 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 HUNKP57058 714 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 GRIK2Q13002 908 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 CPZQ66K79 652 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 METTL6Q8TCB7 284 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ITPAQ9BY32 194 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 APOA1P02647 267 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 RGMBQ6NW40 437 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 GTF2H4Q92759 462 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 KIAA1191Q96A73 305 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SNX18Q96RF0 628 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 KRT87PA6NCN2 255 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 CLDN24A6NM45 220 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 MEN1O00255 615 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SLC2A4P14672 509 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 NUDT6P53370 316 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 P2RX3P56373 397 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 GNG2P59768 71 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 GPLD1P80108 840 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ZNF544Q6NX49 715 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SETD9Q8NE22 299 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SMIM14Q96QK8 99 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 GPR21Q99679 349 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 MED16Q9Y2X0 877 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 MROH6A6NGR9 719 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ANKRD28O15084 1053 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 F9P00740 461 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 HSMCR30P0CW71 290 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 HOXA9P31269 272 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 CTSKP43235 329 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 FADDQ13158 208 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 MADCAM1Q13477 382 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 GALNT3Q14435 633 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 EGLN2Q96KS0 407 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 TLL1O43897 1013 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 NPPAP01160 153 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 MMP2P08253 660 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ITGAMP11215 1152 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ARPP19P56211 112 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SLAMF1Q13291 335 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 TIGD6Q17RP2 521 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX18-202ENST00000343017 SMU1Q2TAY7 513 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms