RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317896.11

HFE-202, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HFE, Length 1,922 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-202ENST00000317896 RB1P06400 928 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 RETP07949 1114 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 IL1RNP18510 177 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 TTPAP49638 278 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 IL5RAQ01344 420 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PRSS48Q7RTY5 328 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 MICU2Q8IYU8 434 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ARL10Q8N8L6 244 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 FBLIM1Q8WUP2 373 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 LINGO1Q96FE5 620 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 GALPQ9UBC7 116 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ZNF225Q9UK10 706 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ERVW-1Q9UQF0 538 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 SCML2Q9UQR0 700 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 C2orf81A6NN90 581 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 M0QX08 132 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ENPP3O14638 875 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 RGS14O43566 566 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PRAMEF11O60813 436 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 B3GAT3O94766 335 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 INMTO95050 263 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ANGPTL1O95841 491 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 G6PDP11413 515 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 TYMPP19971 482 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 TGM1P22735 817 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 SERPINB1P30740 379 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 CTNNB1P35222 781 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ISL1P61371 349 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 MTA1Q13330 715 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PTPRCAPQ14761 206 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 BCL2A1Q16548 175 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PTPRNQ16849 979 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 LEXMQ3ZCV2 418 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ALFQ53S48 1182 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ENPP6Q6UWR7 440 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 Q6ZSR9 355 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 P2RY8Q86VZ1 359 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 OR10T2Q8NGX3 314 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 MCOLN3Q8TDD5 553 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 FAR1Q8WVX9 515 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 NCLNQ969V3 563 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 KLHL25Q9H0H3 589 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 NMUR1Q9HB89 426 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PTGES3LE9PB15 166 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 SLC28A1O00337 649 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 LSM1O15116 133 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 XYLBO75191 536 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 OTCP00480 354 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 IL6P05231 212 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 CAPN1P07384 714 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 COL9A1P20849 921 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 AGXTP21549 392 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PIGAP37287 484 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 DCTP40126 519 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 BRCC3P46736 316 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ST13P50502 369 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ERVPABLB-1P60509 514 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 CXCR4P61073 352 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 CDK5R2Q13319 367 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 IHHQ14623 411 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 MAPKAPK3Q16644 382 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 DPY19L1Q2PZI1 675 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 AP5B1Q2VPB7 878 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ATG9BQ674R7 924 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 GPR149Q86SP6 731 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 SCN4BQ8IWT1 228 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 MFSD4AQ8N468 514 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 LPPQ93052 612 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 YIPF6Q96EC8 236 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 DACH2Q96NX9 599 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 NUDT5Q9UKK9 219 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 ZNF232Q9UNY5 417 aa13.68□□□□□ -0.22
HFE-202ENST00000317896 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms