RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 PRLP01236 227 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 EBLN1P0CF75 366 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 THPOP40225 353 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SLC11A2P49281 568 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 TAF10Q12962 218 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 LAPTM5Q13571 262 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PTGR1Q14914 329 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 GNASQ5JWF2 1037 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 GLB1LQ6UWU2 654 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 GCNT7Q6ZNI0 430 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 HS3ST5Q8IZT8 346 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 EFHBQ8N7U6 833 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 OR7D4Q8NG98 312 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 TBCDQ9BTW9 1192 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 A0A0D9SEW6 157 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ILVBLA1L0T0 632 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 OR6C75A6NL08 312 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 H0Y626 953 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SYN3O14994 580 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PER2O15055 1255 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 AQP9O43315 295 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ACSL4O60488 711 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SEC22BO75396 215 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 CLDN11O75508 207 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 FKBP9O95302 570 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 TRIM16O95361 564 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 DGKAP23743 735 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 MAGEA2P43356 314 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 CSNK2BP67870 215 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PIGFQ07326 219 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ABHD18Q0P651 414 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 NPTX1Q15818 432 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PERM1Q5SV97 790 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 LRIF1Q5T3J3 769 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 MSRB3Q8IXL7 192 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 FRS2Q8WU20 508 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 UBTD2Q8WUN7 234 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ULK4Q96C45 1275 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SPATA17Q96L03 361 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 CLPBQ9H078 707 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 TM9SF3Q9HD45 589 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 WWOXQ9NZC7 414 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 RGS10O43665 173 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 JRKO75564 520 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 CCNDBP1O95273 360 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 NR4A1P22736 598 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ACVR2AP27037 513 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 S100A3P33764 101 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 RGRP47804 291 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 RXRGP48443 463 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 SLC35A2P78381 396 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 RAPSNQ13702 412 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 TTC23LQ6PF05 361 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 DET1Q7L5Y6 550 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PLPP6Q8IY26 295 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 MFSD4AQ8N468 514 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ZFP90Q8TF47 636 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 HBEGFQ99075 208 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 EGFL8Q99944 293 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 NTMT1Q9BV86 223 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 CD244Q9BZW8 370 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa13.55□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 ISPDA4D126 451 aa13.54□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.54□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 KRT6AP02538 564 aa13.54□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 FTH1P02794 183 aa13.54□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 KRT6BP04259 564 aa13.54□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 RHOCP08134 193 aa13.54□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PRPS2P11908 318 aa13.54□□□□□ -0.24
MKS1-201ENST00000313863 PRKACGP22612 351 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms