RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291386.3

SSU72-201, Transcript of SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SSU72, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72-201ENST00000291386 PAQR3Q6TCH7 311 aa26.11■■□□□ 1.77
SSU72-201ENST00000291386 RAB11FIP2Q7L804 512 aa26.11■■□□□ 1.77
SSU72-201ENST00000291386 PRSS42Q7Z5A4 293 aa26.11■■□□□ 1.77
SSU72-201ENST00000291386 CTAGE3PQ8IX95 158 aa26.11■■□□□ 1.77
SSU72-201ENST00000291386 RAD51AP1Q96B01 352 aa26.11■■□□□ 1.77
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SSU72-201ENST00000291386 CD180Q99467 661 aa26.11■■□□□ 1.77
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SSU72-201ENST00000291386 CMKLR1Q99788 373 aa26.11■■□□□ 1.77
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SSU72-201ENST00000291386 ACSS3Q9H6R3 686 aa26.1■■□□□ 1.77
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SSU72-201ENST00000291386 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
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SSU72-201ENST00000291386 FAM153BP0C7A2 387 aa26.07■■□□□ 1.76
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SSU72-201ENST00000291386 FAM153CQ494X1 144 aa26.07■■□□□ 1.76
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SSU72-201ENST00000291386 C2orf74A8MZ97 194 aa26.06■■□□□ 1.76
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SSU72-201ENST00000291386 ABHD2P08910 425 aa26.06■■□□□ 1.76
SSU72-201ENST00000291386 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SSU72-201ENST00000291386 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SSU72-201ENST00000291386 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 41.9
SSU72-201ENST00000291386 CCSMST1Q4G0I0 132 aa26.06■■□□□ 1.76
SSU72-201ENST00000291386 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SSU72-201ENST00000291386 SNAP47Q5SQN1 464 aa26.06■■□□□ 1.76
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