RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acbd4E9Q289 327 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb10E9Q8X5 861 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MttpO08601 894 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dpy19l2P0CW70 773 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PdgfaP20033 211 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HdcP23738 662 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gria2P23819 883 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DctP29812 517 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uba1yP31254 1058 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hcrtr1P58307 416 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pim3P58750 326 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rin3P59729 980 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pip5k1bP70181 539 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ext2P70428 718 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col28a1Q2UY11 1141 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spata6Q3U6K5 488 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CamkvQ3UHL1 512 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Akr1clQ3UXL1 322 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5431Q5NCB3 844 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Taar7aQ5QD12 358 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klf4Q60793 483 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bpifb1Q61114 474 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Six3Q62233 333 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubxn7Q6P5G6 467 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zpbp2Q6X786 326 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc17a6Q8BLE7 582 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rcor1Q8CFE3 480 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lin7aQ8JZS0 233 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trnt1Q8K1J6 434 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trpv3Q8K424 791 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IlkapQ8R0F6 392 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Clptm1Q8VBZ3 664 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr806Q8VFI2 313 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ClpsQ9CQC2 113 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhl28Q9CR40 571 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cxxc1Q9CWW7 660 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q9D112 206 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp5dQ9D3D9 168 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sohlh2Q9D489 467 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HaghlQ9DB32 283 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plin3Q9DBG5 437 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sertad3Q9ERC3 197 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il22bQ9JJY8 179 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hey2Q9QUS4 339 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcne5Q9QZ26 143 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Med20Q9R0X0 212 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdh13Q9WTR5 714 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Insl5Q9WUG6 135 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AicdaQ9WVE0 198 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chd7A2AJK6 2986 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mup6A2AV72 179 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Skint1A7TZE6 364 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp40B1B1D3 796 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm1141B9EJU1 475 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam170bE9PXT9 378 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp871G5E905 615 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pot1bH7BX60 640 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm2888K7N746 267 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r112L7N221 857 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r57L7N269 863 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3488M0QW81 238 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PtgdsO09114 189 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pmm1O35621 262 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mllt10O54826 1068 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LatO54957 242 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FhitO89106 150 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc7a2P18581 657 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ap1g1P22892 822 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gja1P23242 382 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdha2P35487 391 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnfsf4P43488 198 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CratP47934 626 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pebp1P70296 187 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TgfbiP82198 683 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 QrfprP83861 433 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bop1P97452 732 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc74bQ14BP6 391 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prss55Q14BX2 321 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PrtgQ2EY15 1191 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Foxk2Q3UCQ1 651 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm4981Q3ULJ8 291 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Naa11Q3UX61 218 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PtprnQ60673 979 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grb10Q60760 621 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem164Q6PHN7 296 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnk12Q76M80 430 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Letm2Q7TNU7 480 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prr14Q7TPN9 612 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr855Q7TRF8 312 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q810N5 247 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AW551984Q8BGF0 804 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.9 ms