RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HM13	Q8TCT9	377 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GTF2H4	Q92759	462 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM17	Q9Y577	477 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf42	Q9H799	3197 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ARNTL	O00327	626 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	B3GALT4	O96024	378 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GSN	P06396	782 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PGR	P06401	933 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TCF3	P15923	654 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	AKT1	P31749	480 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LAPTM5	Q13571	262 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	STK32C	Q86UX6	486 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD46	Q86W74	232 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	THEG	Q9P2T0	379 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152		A0A087WXM4	84 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	DYTN	A2CJ06	578 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LATS1	O95835	1130 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	UGT2B4	P06133	528 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ANXA6	P08133	673 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CDH1	P12830	882 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SRC	P12931	536 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LHCGR	P22888	699 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CCR7	P32248	378 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CAPG	P40121	348 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA0040	Q15053	153 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM60	Q495X7	471 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	BORA	Q6PGQ7	559 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MACC1	Q6ZN28	852 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TMBIM1	Q969X1	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	OR52E6	Q96RD3	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	COPS8	Q99627	209 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NTN4	Q9HB63	628 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MYO7A	Q13402	2215 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MANBA	O00462	879 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	B4GAT1	O43505	415 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SOCS5	O75159	536 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-F	P30511	346 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NSG1	P42857	185 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	B4GALNT1	Q00973	533 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PTS	Q03393	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CHRNB3	Q05901	458 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GPR141	Q7Z602	305 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ITIH5	Q86UX2	942 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	EBF1	Q9UH73	591 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LRAT	O95237	230 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	OLFM2	O95897	454 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ANXA5	P08758	320 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GGT1	P19440	569 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MTHFR	P42898	656 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TUBA4A	P68366	448 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GPR33	Q49SQ1	333 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MPPE1	Q53F39	396 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NCLN	Q969V3	563 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TSSK3	Q96PN8	268 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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