RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630868.1

CDRT1-208, CMT1A duplicated region transcript 1, human

BASIC

Gene CDRT1, Length 794 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDRT1-208	ENST00000630868	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	F5	P12259	2224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	LINC00473	A8K010	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CLIC2	O15247	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CYTH3	O43739	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	KLK8	O60259	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	GCNT3	O95395	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	OLFM2	O95897	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	KLKB1	P03952	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	C8A	P07357	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	NDUFB7	P17568	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CTPS1	P17812	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SRD5A1	P18405	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	AOC1	P19801	751 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	DNASE1	P24855	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	YWHAQ	P27348	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	FOLR3	P41439	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CENPA	P49450	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CXCR3	P49682	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ZNF131	P52739	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CDH13	P55290	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CAPS	Q13938	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PCYT2	Q99447	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CWH43	Q9H720	699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868		A0A1W2PRV1	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	MEIS2	O14770	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	NUAK1	O60285	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ATP9A	O75110	1047 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ZWINT	O95229	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	TSPAN15	O95858	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	INSRR	P14616	1297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	PRLR	P16471	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	LAG3	P18627	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	ACRV1	P26436	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	KLRC2	P26717	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDRT1-208	ENST00000630868	EPHB2	P29323	1055 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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