RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC45Q96CN5 670 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 VPS4AQ9UN37 437 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEC16AO15027 2179 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 E7EQ34 232 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 METTL18O95568 372 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CETN2P41208 172 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ITGA1P56199 1179 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 DBN1Q16643 649 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZBTB2Q8N680 514 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ICKQ9UPZ9 632 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAP3K7O43318 606 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF749O43361 778 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 VAV2P52735 878 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CACNG1Q06432 222 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 POU6F1Q14863 301 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 NCF4Q15080 339 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PARP6Q2NL67 630 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPESP1Q6UW49 350 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 NUDT9Q9BW91 350 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC88CQ9P219 2028 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF185O15231 689 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 AP2A2O94973 939 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 GSTM1P09488 218 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 GDF10P55107 478 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 GSTM4Q03013 218 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIM73Q86UV7 250 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 STYXQ8WUJ0 223 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PANX2Q96RD6 677 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM60AQ9NP50 221 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC78A2IDD5 438 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 A6NL46 340 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 UGT2B7P16662 529 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 NSG1P42857 185 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATP1A4Q13733 1029 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 MED25Q71SY5 747 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 LUZP4Q9P127 313 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ICE1Q9Y2F5 2266 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR51F1A6NGY5 319 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 C9J4A7 227 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 H3BMH7 237 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 HCRTR1O43613 425 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 DPM1O60762 260 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 AP2A1O95782 977 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 HBQ1P09105 142 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 AGXTP21549 392 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACADLP28330 430 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 BRD3Q15059 726 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZIC1Q15915 447 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 HOOK3Q86VS8 718 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR135Q8IZ08 494 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms