RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 PARP6Q2NL67 630 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 P3H1Q32P28 736 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR33Q49SQ1 333 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCTD11Q693B1 232 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEX19Q8NA77 164 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC13Q8NBP0 860 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPT1BQ92523 772 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ELMO1Q92556 727 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 LUZP4Q9P127 313 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX7Q9UNH6 387 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ICKQ9UPZ9 632 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTRCQ9Y297 605 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2orf74A8MZ97 194 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 E7EVH7 732 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1I1O60431 355 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ETS1P14921 441 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 UGT2B7P16662 529 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTPN4P29074 926 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASQ1P31415 396 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXN2P32314 431 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCL11P51671 97 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXL2P58012 376 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXK1P85037 733 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEMA5AQ13591 1074 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAPSNQ13702 412 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP1A4Q13733 1029 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 UGT8Q16880 541 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1orf189Q5VU69 101 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPESP1Q6UW49 350 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYVN1Q86TM6 617 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOOK3Q86VS8 718 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT222Q8N1A0 295 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MNS1Q8NEH6 495 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 STYXQ8WUJ0 223 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACSS2Q9NR19 701 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASF1AQ9Y294 204 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPTBP11277 2137 aa6.94□□□□□ -1.3
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