RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC20	Q12834	499 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	BRD3	Q15059	726 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR19	Q15760	415 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	KIFC1	Q9BW19	673 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	XKR8	Q9H6D3	395 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	LHX9	Q9NQ69	397 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	BFAR	Q9NZS9	450 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PADI1	Q9ULC6	663 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ASF1A	Q9Y294	204 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	GSAP	A4D1B5	854 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MSL3P1	P0C860	447 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH3	P22223	829 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ARNT	P27540	789 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	NMBR	P28336	390 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNJ11	Q14654	390 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8K5	Q8NH50	307 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A14	Q96JA4	679 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PBK	Q96KB5	322 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CARD6	Q9BX69	1037 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200		F8W8V4	182 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	GPC4	O75487	556 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	NTRK1	P04629	796 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKAR1A	P10644	381 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ST6GAL1	P15907	406 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MGAT1	P26572	445 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TTPA	P49638	278 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MC1R	Q01726	317 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	VRK3	Q8IV63	474 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RY12	Q9H244	342 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	KCND1	Q9NSA2	647 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SYBU	Q9NX95	663 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	POLG2	Q9UHN1	485 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCF5	A8MTL0	148 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf74	A8MZ97	194 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SFTPC	P11686	197 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TCN2	P20062	427 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP1B1	Q16678	543 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SYTL3	Q4VX76	610 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MPP5	Q8N3R9	675 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD3	Q96ES6	412 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	KCND3	Q9UK17	655 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		21.09	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SCRG1	O75711	98 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SHMT2	P34897	504 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CCR10	P46092	362 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	POLE2	P56282	527 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	GPS1	Q13098	491 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SPESP1	Q6UW49	350 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CT55	Q8WUE5	264 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX13	Q9UN79	622 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		21.08	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PIPSL	A2A3N6	862 aa		21.07	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	C21orf140	B9A014	251 aa		21.07	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	21.07	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	AVIL	O75366	819 aa		21.07	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	SLCO2B1	O94956	709 aa		21.07	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	RECK	O95980	971 aa		21.07	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT14	P02533	472 aa		21.07	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	PVR	P15151	417 aa		21.07	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	21.07	■□□□□ 0.96	9e-7	■■■□□ 16.7

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