RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DHRS7Q9Y394 339 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 H0YJX3 145 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TNFRSF11BO00300 401 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF208O43345 1280 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ALPPP05187 535 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MARCKSL1P49006 195 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CHIT1Q13231 466 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SNTA1Q13424 505 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PDK3Q15120 406 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MBLAC2Q68D91 279 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GLYATQ6IB77 296 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LINGO4Q6UY18 593 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LIX1Q8N485 282 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TBATAQ96M53 351 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MGME1Q9BQP7 344 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf109Q9NX04 203 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TNFRSF10BO14763 440 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 BCKDKO14874 412 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FFAR2O15552 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MAPK10P53779 464 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SEMA5AQ13591 1074 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SYVN1Q86TM6 617 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 OR7D4Q8NG98 312 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 EPYCQ99645 322 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DMAC2Q9NW81 257 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0X1KG70 313 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PQY0 241 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF487B1APH4 448 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MAN2B1O00754 1011 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 INPPL1O15357 1258 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NPPAP01160 153 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 OR4Q2P0C623 313 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 BMP6P22004 513 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PBX1P40424 430 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 STARP49675 285 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 HERVK_113P63132 956 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZMYND11Q15326 602 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB6Q15916 424 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FCGR1BQ92637 280 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC32A1Q9H598 525 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 USP54Q70EL1 1684 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PRU2 124 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PRAMEF12O95522 483 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PRPS1L1P21108 318 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DRD4P21917 467 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CPN2P22792 545 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TIE1P35590 1138 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEA11P43364 429 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SERINC3Q13530 473 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TAF5Q15542 800 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 IL23RQ5VWK5 629 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PDPRQ8NCN5 879 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 COQ7Q99807 217 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MECRQ9BV79 373 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NHSQ6T4R5 1651 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 KDELR3O43731 214 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FGF18O76093 207 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NR4A1P22736 598 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NMBRP28336 390 aa6.29□□□□□ -1.4
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