RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 FGGP02679 453 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CXCR5P32302 372 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 FOXN2P32314 431 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 KCNJ1P48048 391 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TERF1P54274 439 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 SEMA5AQ13591 1074 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 DNASE1L3Q13609 305 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 C4orf22Q6V702 233 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CARFQ8N187 725 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TRIM58Q8NG06 486 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 OR52E1Q8NGJ3 308 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 MR1Q95460 341 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ZNF778Q96MU6 729 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 RANBP9Q96S59 729 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 NRTNQ99748 197 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TLR10Q9BXR5 811 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CASS4Q9NQ75 786 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 POLG2Q9UHN1 485 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 AP3B1O00203 1094 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 KDM1AO60341 852 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CREG1O75629 220 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 WISP1O95388 367 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 PSMA3P25788 255 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 NPY2RP49146 381 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 KCNC4Q03721 635 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ABRQ12979 859 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 PCID2Q5JVF3 399 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 PACS1Q6VY07 963 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 OR8K5Q8NH50 307 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CFAP61Q8NHU2 1237 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CT55Q8WUE5 264 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CPT1BQ92523 772 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 BFARQ9NZS9 450 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 POMT2Q9UKY4 750 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 POLHQ9Y253 713 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 BTRCQ9Y297 605 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 IQCF5A8MTL0 148 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ISM1B1AKI9 464 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 C21orf140B9A014 251 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 APOA4P06727 396 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 FURINP09958 794 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 PVRP15151 417 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ST6GAL1P15907 406 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CYP2A7P20853 494 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ACADLP28330 430 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 PTPN4P29074 926 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 SHMT2P34897 504 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TTPAP49638 278 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 CRADDP78560 199 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 TMEM135Q86UB9 458 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-222ENST00000540445 GPR135Q8IZ08 494 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms