RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 KCNAB1Q14722 419 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 MANEAQ5SRI9 462 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 NEPROQ6NW34 567 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CEACAM20Q6UY09 585 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CENPUQ71F23 418 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TMEM135Q86UB9 458 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 UBXN4Q92575 508 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 LPGAT1Q92604 370 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 NKD1Q969G9 470 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 FAM136AQ96C01 138 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 PWWP2AQ96N64 755 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 BIRC8Q96P09 236 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CD180Q99467 661 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CARD6Q9BX69 1037 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 SPRY4Q9C004 299 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 GNPTGQ9UJJ9 305 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ICKQ9UPZ9 632 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ATMQ13315 3056 aa7.29□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 K7ENP7 123 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TTI1O43156 1089 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 RAD1O60671 282 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 NIPSNAP2O75323 286 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 STK17BO94768 372 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 USP1O94782 785 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TIAF1O95411 115 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 S1PR4O95977 384 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 EBLN1P0CF75 366 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 FOLR1P15328 257 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ZNF28P17035 718 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CDH3P22223 829 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 IVDP26440 423 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 AOAHP28039 575 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ARL4DP49703 201 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ATP1A2P50993 1020 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CTBP1Q13363 440 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TUBB3Q13509 450 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TMED2Q15363 201 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 GPR19Q15760 415 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 LONRF1Q17RB8 773 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 MSS51Q4VC12 460 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ARMC3Q5W041 872 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ZNF470Q6ECI4 717 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 PCGF5Q86SE9 256 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 LRRC6Q86X45 466 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 D2HGDHQ8N465 521 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.28□□□□□ -1.24
PATJ-211ENST00000493967 PANX3Q96QZ0 392 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms