RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489157.5

TAPBP-241, Transcript of TAP binding protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TAPBP, Length 1,299 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBP-241ENST00000489157 CLIP3Q96DZ5 547 aa13.7□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa13.7□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa13.7□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 GPR87Q9BY21 358 aa13.7□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.7□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ICKQ9UPZ9 632 aa13.7□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa13.7□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 NUP210LQ5VU65 1888 aa13.7□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 MEN1O00255 615 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 HCRTR1O43613 425 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 RECKO95980 971 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CAPN1P07384 714 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 MSNP26038 577 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 RORAP35398 523 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 GRIA1P42261 906 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 PTGIRP43119 386 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 PTCHD3Q3KNS1 767 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 SYVN1Q86TM6 617 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 AMIGO1Q86WK6 493 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CARFQ8N187 725 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 TTC13Q8NBP0 860 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 OR8K5Q8NH50 307 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 STYXQ8WUJ0 223 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CPT1BQ92523 772 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 LRRC45Q96CN5 670 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 C19orf43Q9BQ61 176 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 PITPNM3Q9BZ71 974 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 MVB12BQ9H7P6 319 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 FANCEQ9HB96 536 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 LATS2Q9NRM7 1088 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 PCMTD2Q9NV79 361 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ACTR10Q9NZ32 417 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 PLAGL1Q9UM63 463 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 DOCK10Q96BY6 2186 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ESPL1Q14674 2120 aa13.69□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 PCM1Q15154 2024 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 MROH6A6NGR9 719 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 MATN2O00339 956 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 OR1I1O60431 355 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CTSBP07858 339 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 TPBGLP0DKB5 382 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ETS1P14921 441 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CYP2A7P20853 494 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 FOXN2P32314 431 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CD151P48509 253 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CCL11P51671 97 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 KIF5AQ12840 1032 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 DEFB110Q30KQ9 67 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 P3H1Q32P28 736 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 IZUMO3Q5VZ72 239 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 FAM198BQ6UWH4 519 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 SYTL1Q8IYJ3 562 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 SYCE1Q8N0S2 351 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ELMO1Q92556 727 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 MIB2Q96AX9 1013 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 HES6Q96HZ4 224 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 VPS37BQ9H9H4 285 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 FAM60AQ9NP50 221 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 SPHK1Q9NYA1 384 aa13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 C2orf74A8MZ97 194 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 UGT2B7P16662 529 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 PSMA3P25788 255 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ACADLP28330 430 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 NSG1P42857 185 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 RPA4Q13156 261 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ZIC1Q15915 447 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 NADK2Q4G0N4 442 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 SPESP1Q6UW49 350 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 DNAAF3Q8N9W5 541 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 THAP4Q8WY91 577 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ZNF778Q96MU6 729 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 LRFN5Q96NI6 719 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ALS2CR12Q96Q35 445 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ING2Q9H160 280 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ETNK1Q9HBU6 452 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ACSS2Q9NR19 701 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 TCFL5Q9UL49 500 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 SNX7Q9UNH6 387 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 ASF1AQ9Y294 204 aa13.67□□□□□ -0.22
TAPBP-241ENST00000489157 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.5 ms