RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 REM1O75628 298 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GJD3Q8N144 294 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C17orf50Q8WW18 174 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDHA2P29803 388 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PITPNAQ00169 270 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLEC4DQ8WXI8 215 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PER2O15055 1255 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC30A6Q6NXT4 461 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAC4Q86UU9 113 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FATE1Q969F0 183 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARPC2O15144 300 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHG6Q3KR16 790 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MGME1Q9BQP7 344 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UPB1Q9UBR1 384 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2AG2A6NM03 316 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASGR1P07306 291 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLUD2P49448 558 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL26P61254 145 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHL22Q53GT1 634 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMARCD3Q6STE5 483 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DTLQ9NZJ0 730 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.88■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 INSIG1O15503 277 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFV1P49821 464 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SULT2A1Q06520 285 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMC8Q8IU68 726 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTRRQ9UBK8 725 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACOX3O15254 700 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IST1P53990 364 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TUSC3Q13454 348 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSPBAP1Q96EW2 488 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NT5EP21589 574 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GANABQ14697 944 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ING5Q8WYH8 240 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKP2Q99959 881 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GABRR2P28476 465 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PITPNM1O00562 1244 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK14O94921 469 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TFPIP10646 304 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HERVK_113P63132 956 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDSS2Q86YH6 399 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC58Q96CX6 371 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNC2Q96PR1 638 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52B2Q96RD2 323 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERVK-6Q9BXR3 956 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MLXQ9UH92 298 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDST2P52849 883 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STON2Q8WXE9 905 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AASSQ9UDR5 926 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR6C70A6NIJ9 312 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC7A4O43246 635 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSTT2BP0CG30 244 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IMPDH1P20839 514 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PBX3P40426 434 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLOD2O00469 737 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPAN1O60635 241 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1D2P34982 312 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERVK-8P63133 956 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms