RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476335.1

ELL3-204, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, human

TSL 2

Gene ELL3, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELL3-204	ENST00000476335	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	C2orf74	A8MZ97	194 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	JRK	O75564	520 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PROSC	O94903	275 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PYGM	P11217	842 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	TDGF1P3	P51864	188 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	WNT3A	P56704	352 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PTPRCAP	Q14761	206 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	TLR1	Q15399	786 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	TEX44	Q53QW1	395 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	NPNT	Q6UXI9	565 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	NACC2	Q96BF6	587 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	CNDP1	Q96KN2	507 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	DEF6	Q9H4E7	631 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	OLAH	Q9NV23	265 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	SOCS6	O14544	535 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PCDH17	O14917	1159 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PRAMEF1	O95521	474 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	EPO	P01588	193 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	MMP11	P24347	488 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PTPN3	P26045	913 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	KCNK10	P57789	538 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PDK1	Q15118	436 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	FCRL6	Q6DN72	434 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	SPESP1	Q6UW49	350 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	TRIM73	Q86UV7	250 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	NXPE1	Q8N323	547 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	BCORP1	Q8N888	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	HM13	Q8TCT9	377 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF398	Q8TD17	642 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	TEKT5	Q96M29	485 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	XKR8	Q9H6D3	395 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ANO10	Q9NW15	660 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	HACD3	Q9P035	362 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PKP3	Q9Y446	797 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335		A0A087X0T9	212 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF487	B1APH4	448 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	FAM228B	P0C875	321 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ITGAX	P20702	1163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	HTR1E	P28566	365 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	GCGR	P47871	477 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PRLHR	P49683	370 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	SLC1A5	Q15758	541 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	SARM1	Q6SZW1	724 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PHC3	Q8NDX5	983 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	CCDC120	Q96HB5	630 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	CHST11	Q9NPF2	352 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	LRRD1	A4D1F6	860 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	APOL1	O14791	398 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	COX6B1	P14854	86 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	UGT2B7	P16662	529 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	NFKB1	P19838	968 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	TMPRSS15	P98073	1019 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335		Q0VFX4	171 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	WASHC5	Q12768	1159 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	STX1A	Q16623	288 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ELL3-204	ENST00000476335	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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