RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467081.1

CCNL1-209, Transcript of cyclin L1, human

TSL 3

Gene CCNL1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-209	ENST00000467081	SNX16	P57768	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	SIRPA	P78324	504 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	DMPK	Q09013	629 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	HYKK	A2RU49	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	AVIL	O75366	819 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	PIGN	O95427	931 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	ALOX12	P18054	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	ACSL1	P33121	698 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	CX3CL1	P78423	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	SP3	Q02447	781 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	GPR17	Q13304	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	P2RY6	Q15077	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNL1-209	ENST00000467081	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	TSPAN9	O75954	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	STARD3NL	O95772	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	CSH1	P0DML2	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	CSH2	P0DML3	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	AKR1B1	P15121	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	GJA1	P17302	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	CDK3	Q00526	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	CDR2	Q01850	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	CUL4A	Q13619	759 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	NR1D2	Q14995	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	WTAP	Q15007	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	TAF13	Q15543	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-209	ENST00000467081	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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