RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 TXLNGYQ9BZA5 131 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RHOJQ9H4E5 214 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 POT1Q9NUX5 634 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R13Q9NYV9 303 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PSAT1Q9Y617 370 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CACNA1GO43497 2377 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52A4PA6NMU1 304 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MYBL2P10244 700 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFS1P28331 727 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PDHA2P29803 388 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP5DP30049 168 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GP5P40197 560 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR3P46089 330 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CLCN7P51798 805 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP4F3Q08477 520 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC157Q569K6 752 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GRTP1Q5TC63 336 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM45BPQ6NSW5 357 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NAPRTQ6XQN6 538 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC22A15Q8IZD6 547 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB2Q8N680 514 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PPM1NQ8N819 430 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM45AQ8TCE6 357 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFPM2Q8WW38 1151 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 INPP5DQ92835 1189 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC74AQ96AQ1 378 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ACSS3Q9H6R3 686 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 UCK1Q9HA47 277 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 VWA7Q9Y334 891 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 DHRS7Q9Y394 339 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM149AA5PLN7 773 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PPM1DO15297 605 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZZEF1O43149 2961 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ABHD2P08910 425 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CCT5P48643 541 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NR1D2Q14995 579 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 HECTD2Q5U5R9 776 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NDNQ99608 321 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC38A3Q99624 504 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR21Q99679 349 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC3Q9BQI4 270 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CDYLQ9Y232 598 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MED16Q9Y2X0 877 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SPEGQ15772 3267 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RIPK2O43353 540 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PIAS1O75925 651 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ACADLP28330 430 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRP35270 261 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCG1P45844 678 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT33BQ14525 404 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GBX1Q14549 363 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL38Q2WGJ6 581 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PERM1Q5SV97 790 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR48Q8TAF3 677 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM136AQ96C01 138 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS39Q96JC1 886 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ELMO2Q96JJ3 720 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCG4Q9H172 646 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MVB12BQ9H7P6 319 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC40A1Q9NP59 571 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GALPQ9UBC7 116 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087WV48 116 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 AGPSO00116 658 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CBSLP0DN79 551 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 FDXRP22570 491 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CBSP35520 551 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CDKN2DP55273 166 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 NEK10Q6ZWH5 1172 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 VRK3Q8IV63 474 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 NXPE2Q96DL1 559 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CABS1Q96KC9 395 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 FERD3LQ96RJ6 166 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RBBP8Q99708 897 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CAPS2Q9BXY5 557 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ASF1AQ9Y294 204 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 LILRA5A6NI73 299 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms