RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 KRT87PA6NCN2 255 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 METTL12A8MUP2 240 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 MEI4A8MW99 385 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 DCXO43602 365 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 AP1S2P56377 157 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 NAA20P61599 178 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 19.4
ATG4B-204ENST00000402096 METRNLQ641Q3 311 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TSSK4Q6SA08 328 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 PDZD3Q86UT5 571 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TCAIMQ8N3R3 496 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM79Q9BSE2 394 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 HGH1Q9BTY7 390 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 WWP1Q9H0M0 922 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 CIDEBQ9UHD4 219 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 USH1CQ9Y6N9 552 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 AOC1P19801 751 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 DMWDQ09019 674 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 CDKL4Q5MAI5 379 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 FOXR1Q6PIV2 292 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 CADM4Q8NFZ8 388 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 SLC6A18Q96N87 628 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 CD244Q9BZW8 370 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 OPTCQ9UBM4 332 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ACSL5Q9ULC5 683 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ASF1AQ9Y294 204 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 E2F3O00716 465 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 KCNJ13O60928 360 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 C1orf105O95561 183 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 THEGLP0DJG4 465 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 HNMTP50135 292 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 CLCNKAP51800 687 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 DMPKQ09013 629 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 LCP2Q13094 533 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 GTF2H2Q13888 395 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 PTK2BQ14289 1009 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TCEA2Q15560 299 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 CCSMST1Q4G0I0 132 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TJAP1Q5JTD0 557 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 RASGRP3Q8IV61 690 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TEX9Q8N6V9 391 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 UBTD2Q8WUN7 234 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 SIKE1Q9BRV8 207 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 KCNK13Q9HB14 408 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 KCNK4Q9NYG8 393 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 EBAG9O00559 213 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 PPP6CO00743 305 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TNFRSF10CO14798 259 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 GIPC1O14908 333 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 STK16O75716 305 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 RASGRP1O95267 797 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 IDSP22304 550 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 CD27P26842 260 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ACADLP28330 430 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 GDF5P43026 501 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 SRP54P61011 504 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 UNC5DQ6UXZ4 953 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 HID1Q8IV36 788 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ATP6V1E2Q96A05 226 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 KLHDC7BQ96G42 594 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC138Q96M89 665 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ORAI3Q9BRQ5 295 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 HAO1Q9UJM8 370 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 FANCMQ8IYD8 2048 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM233B4DJY2 109 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 HGSO14964 777 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 CRCPO75575 148 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 MLYCDO95822 493 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 BCKDHBP21953 392 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 MAOBP27338 520 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 HK2P52789 917 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 SH3BP2P78314 561 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ZSCAN26Q16670 478 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 ALG11Q2TAA5 492 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 TTC23LQ6PF05 361 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 MAMSTRQ6ZN01 415 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-204ENST00000402096 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms