RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CYB5D1Q6P9G0 228 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 LAYNQ6UX15 382 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CLYBLQ8N0X4 340 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 METTL6Q8TCB7 284 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 MED8Q96G25 268 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 THTPAQ9BU02 230 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PRM3Q9NNZ6 103 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CA14Q9ULX7 337 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 SLC22A14Q9Y267 594 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 OARD1Q9Y530 152 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PLXNA2O75051 1894 aa10.74□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PQU0 124 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 SHISA7A6NL88 538 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 KLK8O60259 260 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 GPC4O75487 556 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 TM7SF2O76062 418 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PDE5AO76074 875 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CALB2P22676 271 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 NFKBIAP25963 317 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ACSL1P33121 698 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PXNP49023 591 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PRKG2Q13237 762 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 WLSQ5T9L3 541 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 FAM46CQ5VWP2 391 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PAOXQ6QHF9 649 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 HMGCLL1Q8TB92 370 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 HMGB4Q8WW32 186 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ASB11Q8WXH4 323 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM159Q96B96 161 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 NPAS2Q99743 824 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 BTBD10Q9BSF8 475 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 SMOXQ9NWM0 555 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CFAP54Q96N23 3096 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ARHGEF33A8MVX0 844 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 LOC730098B7Z3J9 87 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 GSC2O15499 205 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CFLARO15519 480 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ATG13O75143 517 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ENTPD5O75356 428 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 POP7O75817 140 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 DNTTP04053 509 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CD9P21926 228 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 YBX1P67809 324 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 STARD3Q14849 445 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PTCHD3Q3KNS1 767 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 LDLRAP1Q5SW96 308 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 SDE2Q6IQ49 451 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ASZ1Q8WWH4 475 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 NECTIN4Q96NY8 510 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 HDAC8Q9BY41 377 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM8Q9BZR9 551 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 KLC4Q9NSK0 619 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 NUDT4Q9NZJ9 180 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 OPTCQ9UBM4 332 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 POLG2Q9UHN1 485 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CKAP5Q14008 2032 aa10.73□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 GIPC1O14908 333 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 UBDO15205 165 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 COX4I1P13073 169 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 HGFP14210 728 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 IL9P15248 144 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 HMGCS1Q01581 520 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 KRT72Q14CN4 511 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ABRAXAS2Q15018 415 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 IRF4Q15306 451 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 ADNP2Q6IQ32 1131 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PNCKQ6P2M8 343 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 IL27RAQ6UWB1 636 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 PGBD3Q8N328 593 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 KIAA1958Q8N8K9 716 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CEP70Q8NHQ1 597 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 RCN3Q96D15 328 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CCM2Q9BSQ5 444 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 CD244Q9BZW8 370 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 MEAF6Q9HAF1 191 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 TRPC5OSA6NMA1 111 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 H0Y3Z8 333 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 H0Y858 1186 aa10.72□□□□□ -0.69
GGPS1-201ENST00000282841 RASSF9O75901 435 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms