RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.99■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.99■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.98■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 OR8H2Q8N162 312 aa15.98■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 TMEM181Q9P2C4 612 aa15.98■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 FTH1P02794 183 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 RXRGP48443 463 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 COPZ1P61923 177 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 SMYD1Q8NB12 490 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.97■□□□□ 0.15
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