RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lingo3Q6GQU6 589 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rccd1Q8BTU7 377 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nipal4Q8BZF2 406 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rcor1Q8CFE3 480 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 NraddQ8CJ26 228 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dennd1aQ8K382 1016 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 GatbQ99JT1 557 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Scd3Q99PL7 359 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Txndc12Q9CQU0 170 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 ProzQ9CQW3 399 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lsm12Q9D0R8 195 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Oser1Q9D722 291 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ddx59Q9DBN9 619 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 IvdQ9JHI5 424 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem236A2ARJ3 344 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kif28pD3YXS5 1028 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mkrn2osD3Z393 217 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr564E9PWA8 316 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Erich2E9Q1A6 463 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r14E9Q759 848 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm10722F6VLK5 217 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dusp8O09112 663 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sult3a1O35403 293 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hcn4O70507 1186 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 P01740 135 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ubl4aP21126 157 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gsx2P31316 305 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prim2P33610 505 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kcnn3P58391 732 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nol9Q3TZX8 714 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ggt1Q60928 568 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 ProcrQ64695 242 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tha1Q6XPS7 400 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 MroQ7TNB4 248 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 WtipQ7TQJ8 398 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sgo2Q7TSY8 1164 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dclre1cQ8K4J0 705 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mptx1Q8R1M8 219 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nphs2Q91X05 385 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Isl2Q9CXV0 359 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lcn9Q9D267 178 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Echdc3Q9D7J9 300 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 TesclQ9DAJ7 231 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hmgn3Q9DCB1 99 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tomm20Q9DCC8 145 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gdf2Q9WV56 428 aa6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 CatsperbA2RTF1 1109 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nt5c1aA3KFX0 365 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm7971J3QMM8 481 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 E2f2P56931 443 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Wdr5P61965 334 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ctps2P70303 586 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sh3bp2Q06649 559 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mageb5Q14AN0 366 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 FaddQ61160 205 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sdc3Q64519 442 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ell3Q80VR2 395 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp418Q8BFS8 652 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf750Q8BH05 703 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gabra5Q8BHJ7 463 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Plekhs1Q8BW88 474 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 St8sia6Q8K4T1 398 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rnf113a1Q8R3P8 341 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cd207Q8VBX4 331 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Grhl1Q921D9 618 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ap1s2Q9DB50 160 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cmpk1Q9DBP5 196 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mllt3A2AM29 569 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 CtcflA2APF3 636 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm11758A2BEI6 360 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm11757A2BEI8 360 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm10719E9Q7T3 227 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp758E9QAA1 583 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 F830016B08RikG3UWE2 416 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cbx4O55187 551 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Alas2P08680 587 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sult2a2P50236 285 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Polr3bP59470 1133 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Usp46P62069 366 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mtf2Q02395 593 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf367Q0VDT2 340 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hhla1Q3TYV2 514 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Adam2Q60718 735 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Il10raQ61727 575 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rapgefl1Q68EF8 662 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tlr12Q6QNU9 906 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mup21Q80YX8 181 aa6.92□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc71Q8VEG0 433 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms