RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CASP14	P31944	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CD70	P32970	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KRT2	P35908	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PBX1	P40424	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TUB	P50607	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	VAMP7	P51809	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KCNK10	P57789	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PROK1	P58294	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MCL1	Q07820	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PIM3	Q86V86	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63	5e-7	■■■■■ 48.3
MLH1-223	ENST00000616768	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RAD51B	O15315	384 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SLC16A4	O15374	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CRLF1	O75462	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CREG1	O75629	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NXPH3	O95157	252 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KIF20A	O95235	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CPNE6	O95741	557 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DNASE1	P24855	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CHKA	P35790	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DGKQ	P52824	942 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	THOP1	P52888	689 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	OR1D5	P58170	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TAS2R38	P59533	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CUL4A	Q13619	759 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	IL17A	Q16552	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ESX1	Q8N693	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768		H7C1Q1	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	B4GAT1	O43505	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MED24	O75448	989 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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