RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NAT14	Q8WUY8	206 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ASF1A	Q9Y294	204 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A1W2PQM1	296 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PROS1	P07225	676 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	AMD1	P17707	334 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ITGB6	P18564	788 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RGS4	P49798	205 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	OR1D5	P58170	312 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	MPP1	Q00013	466 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	AMZ1	Q400G9	498 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	XKR5	Q6UX68	686 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CARF	Q8N187	725 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	KRT222	Q8N1A0	295 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	INPP5D	Q92835	1189 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CPNE1	Q99829	537 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	IQCF5	A8MTL0	148 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	B4GAT1	O43505	415 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CS	O75390	466 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	HAUS5	O94927	633 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	AHSG	P02765	367 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	MCM3	P25205	808 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ACADL	P28330	430 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CD1C	P29017	333 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PDHA2	P29803	388 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SSTR1	P30872	391 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SHMT2	P34897	504 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	GP5	P40197	560 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CLCN7	P51798	805 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	INHBC	P55103	352 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	GBX1	Q14549	363 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	BRD3	Q15059	726 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TRADD	Q15628	312 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NXPE2	Q96DL1	559 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CYTH2	Q99418	400 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CD180	Q99467	661 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	DHRS7	Q9Y394	339 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-215	ENST00000596522	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2

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