RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581093.1

SENP3-206, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene SENP3, Length 493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-206ENST00000581093 ADAM20O43506 726 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PCDHGA12O60330 932 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ATP6V1G2O95670 118 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ONECUT2O95948 504 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ITGAVP06756 1048 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ANXA5P08758 320 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 GNAO1P09471 354 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 TCF4P15884 667 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 KRT15P19012 456 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 NFKB1P19838 968 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 MX1P20591 662 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 NT5EP21589 574 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PON1P27169 355 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 RORAP35398 523 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 TALDO1P37837 337 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 GNG10P50151 68 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 SLC26A2P50443 739 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ACTR3P61158 418 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 TNFRSF17Q02223 184 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 GHRHRQ02643 423 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 STX5Q13190 355 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 MAB21L1Q13394 359 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 LTB4RQ15722 352 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 RNF220Q5VTB9 566 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 HGSNATQ68CP4 663 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ANO7Q6IWH7 933 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 USP49Q70CQ1 688 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PEX26Q7Z412 305 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 LINC00523Q86TU6 105 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 TTC7BQ86TV6 843 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 GID4Q8IVV7 300 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 NAGSQ8N159 534 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ZNF366Q8N895 744 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 C12orf29Q8N999 325 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 BBS10Q8TAM1 723 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 DTD1Q8TEA8 209 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PROX1Q92786 737 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 GLG1Q92896 1179 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 MUL1Q969V5 352 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 APOLD1Q96LR9 279 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 CNPY3Q9BT09 278 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 OR51B6Q9H340 312 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 CWH43Q9H720 699 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 KLHL1Q9NR64 748 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 LRFN1Q9P244 771 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 SCOCQ9UIL1 159 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PADI3Q9ULW8 664 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 HPSEQ9Y251 543 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP3-206ENST00000581093 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.65□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 A0A0J9YYE9 177 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 HMX3A6NHT5 357 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 H3BQF6 201 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 CLDN4O14493 209 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 SOCS6O14544 535 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 ITGB1BP1O14713 200 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 SLC16A6O15403 523 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 AP5Z1O43299 807 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 LRRTM2O43300 516 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 SEC14L5O43304 696 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 ZNF202O95125 648 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 ZFPL1O95159 310 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP3-206ENST00000581093 CXCL14O95715 111 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms