RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa27.43■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR52A5Q9H2C5 316 aa27.43■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LATS2Q9NRM7 1088 aa27.43■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AMFRQ9UKV5 643 aa27.43■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 POU6F1Q14863 301 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCTD11Q693B1 232 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PEX26Q7Z412 305 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIAA1328Q86T90 577 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC38A9Q8NBW4 561 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PHC3Q8NDX5 983 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 THAP4Q8WY91 577 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM55Q9BYV6 548 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHST8Q9H2A9 424 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRRC40Q9H9A6 602 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 H7C0S8 307 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BTN3A1O00481 513 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 METTL18O95568 372 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDHA2P29803 388 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PREPP48147 710 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GSDMDP57764 484 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IL10RAQ13651 578 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLDN19Q8N6F1 224 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBL4BQ8N7F7 174 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CPT1BQ92523 772 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLAAQ9Y263 795 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRRK2Q5S007 2527 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NAV2Q8IVL1 2488 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BTN3A3O00478 584 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD151P48509 253 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABRQ12979 859 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR52E1Q8NGJ3 308 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLIP3Q96DZ5 547 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRFN5Q96NI6 719 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALS2CR12Q96Q35 445 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NRTNQ99748 197 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HGH1Q9BTY7 390 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MVB12BQ9H7P6 319 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM150CB9EJG8 249 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MEN1O00255 615 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAP3K7O43318 606 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ST6GAL1P15907 406 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CACNG1Q06432 222 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHAF1BQ13112 559 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPA4Q13156 261 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRKG2Q13237 762 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LAMB3Q13751 1172 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 P3H1Q32P28 736 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IZUMO3Q5VZ72 239 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CPZQ66K79 652 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PIANPQ8IYJ0 282 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STYXQ8WUJ0 223 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC78A2IDD5 438 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARGFXA6NJG6 315 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDGFAP04085 211 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CYP2A7P20853 494 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LMAN1P49257 510 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GDF10P55107 478 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DBN1Q16643 649 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AMIGO1Q86WK6 493 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DSELQ8IZU8 1212 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYCE1Q8N0S2 351 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR1L3Q8NH93 324 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM121Q9BTD3 319 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KLHL25Q9H0H3 589 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 XKR8Q9H6D3 395 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYTL2Q9HCH5 934 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ACSS2Q9NR19 701 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C2orf74A8MZ97 194 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FTCDO95954 541 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MLLT10P55197 1068 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LCN10Q6JVE6 187 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MIB2Q96AX9 1013 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PITPNM3Q9BZ71 974 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNX7Q9UNH6 387 aa27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms