RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	USP47	Q96K76	1375 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ENO4	A6NNW6	628 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF11	O60813	436 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFS7	O75251	213 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SOX30	O94993	753 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP11B2	P19099	503 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	UGT1A1	P22309	533 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	BDKRB2	P30411	391 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	GABRA5	P31644	462 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS19	P49795	217 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPZA1	P52907	286 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ZP1	P60852	638 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MZT1	Q08AG7	82 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2V1	Q13404	147 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PTK6	Q13882	451 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MELK	Q14680	651 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308		Q4G0T1	1027 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	C10orf25	Q5T742	122 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	FRG2	Q64ET8	278 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	IYD	Q6PHW0	289 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TAAR8	Q969N4	342 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX21	Q969T3	373 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	COQ8B	Q96D53	544 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	BECN2	A8MW95	431 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MS4A18	H0YCH9	400 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	T	O15178	435 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFS4	O43181	175 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SPINT2	O43291	252 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ITM2A	O43736	263 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CAMTA2	O94983	1202 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	GBA	P04062	536 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	LCAT	P04180	440 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ARSB	P15848	533 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PDGFRA	P16234	1089 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPA4	P34932	840 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PCGF2	P35227	344 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	CLDN20	P56880	219 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TAS2R38	P59533	333 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	SCN1B	Q07699	218 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXM1	Q08050	763 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR18	Q14330	331 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	ETFDH	Q16134	617 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	MORN5	Q5VZ52	161 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	C18orf63	Q68DL7	685 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT39	Q6A163	491 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	EMC1	Q8N766	993 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNHG1-222	ENST00000545308	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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