RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 PGK1P00558 417 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CALCAP01258 141 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CBSLP0DN79 551 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 LAP3P28838 519 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 MAPK4P31152 587 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 MPIP34949 423 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CBSP35520 551 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 HMGCS2P54868 508 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ERVK-25P63136 954 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 STX4Q12846 297 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 OXA1LQ15070 435 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ECM1Q16610 540 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ELP2Q6IA86 826 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 VITQ6UXI7 678 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 SPATC1Q76KD6 591 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 GPR149Q86SP6 731 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 FIBCD1Q8N539 461 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 NR4A3Q92570 626 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TMEM143Q96AN5 459 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TMEM74Q96NL1 305 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 NEU1Q99519 415 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 NLNQ9BYT8 704 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TRIM9Q9C026 710 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PSAT1Q9Y617 370 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 J3QW42 95 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 EDIL3O43854 480 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 SCO1O75880 301 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ZFPL1O95159 310 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TYMPP19971 482 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 MSH3P20585 1137 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 EPHB2P29323 1055 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 UQCRC1P31930 480 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 BTKQ06187 659 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 GRM2Q14416 872 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 RPS6KA2Q15349 733 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 DHFR2Q86XF0 187 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 EID3Q8N140 333 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 SLC35F6Q8N357 371 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 MREGQ8N565 214 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 FAM13CQ8NE31 585 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 LIPHQ8WWY8 451 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 BTBD9Q96Q07 612 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 DUSP26Q9BV47 211 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 TASP1Q9H6P5 420 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 POLD4Q9HCU8 107 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 COA4Q9NYJ1 87 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ABCB11O95342 1321 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
LMO3-225ENST00000541295 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 WASH3PC4AMC7 463 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 H3BNX3 289 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 FCHO1O14526 889 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 TPP1O14773 563 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 ITM2AO43736 263 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 UGT1A9O60656 530 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 UNC5CO95185 931 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 PAPLNO95428 1278 aa6.09□□□□□ -1.44
LMO3-225ENST00000541295 ERBB2P04626 1255 aa6.09□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms