RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531897.5

PUF60-216, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5

Gene PUF60, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-216ENST00000531897 TAS2R13Q9NYV9 303 aa21.9■■□□□ 1.1
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PUF60-216ENST00000531897 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PUF60-216ENST00000531897 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.85■■□□□ 1.09
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PUF60-216ENST00000531897 CD200R1Q8TD46 325 aa21.85■■□□□ 1.09
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