RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246		K7ENP7	123 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TK2	O00142	265 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SMAP	O00193	183 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	STK17B	O94768	372 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	VAPB	O95292	243 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SFTPC	P11686	197 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ARSD	P51689	593 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ACVR1	Q04771	509 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBB3	Q13509	450 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	BRD3	Q15059	726 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MCU	Q8NE86	351 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CTRC	Q99895	268 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KIFC1	Q9BW19	673 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC188	H7C350	402 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ITGB6	P18564	788 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRM3	P20309	590 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CA5A	P35218	305 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PREP	P48147	710 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ABHD18	Q0P651	414 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKG2	Q13237	762 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP7	Q14244	749 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	WBP1	Q96G27	269 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CATSPER2	Q96P56	530 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	PIPSL	A2A3N6	862 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	EFS	O43281	561 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	SGTA	O43765	313 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1I1	O60431	355 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC4	O95801	387 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	ESR1	P03372	595 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	ITGB2	P05107	769 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	HBQ1	P09105	142 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS56	P0CW18	603 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	NMBR	P28336	390 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNF	P41002	786 aa		11.02	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms