RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 CD274Q9NZQ7 290 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 TARM1B6A8C7 271 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 UBXN8O00124 270 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 BIRC5O15392 142 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 MATN4O95460 622 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 S100BP04271 92 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 GFAPP14136 432 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 HIST1H2ADP20671 130 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 CYP2A7P20853 494 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 ACTR1BP42025 376 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 NXPH1P58417 271 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 ACTR1AP61163 376 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 PCLAFQ15004 111 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 SLC30A9Q6PML9 568 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 SBSNQ6UWP8 590 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 CCL4L1Q8NHW4 92 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 PHF21BQ96EK2 531 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 WWP1Q9H0M0 922 aa21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.55■■□□□ 1.04
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PSPC1-204ENST00000492741 KLF15Q9UIH9 416 aa21.55■■□□□ 1.04
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PSPC1-204ENST00000492741 RPIAP49247 311 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 SP140Q13342 867 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 TGFBIQ15582 683 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 XKR5Q6UX68 686 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 PDZD3Q86UT5 571 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 MCOLN3Q8TDD5 553 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 EGFL8Q99944 293 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 CAPS2Q9BXY5 557 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 GSDMCQ9BYG8 508 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 PARVBQ9HBI1 364 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 ADAM21Q9UKJ8 722 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 OARD1Q9Y530 152 aa21.54■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1B0GVT2 93 aa21.53■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 NEMP2A6NFY4 417 aa21.53■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 GFYI3L273 518 aa21.53■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 SLC16A5O15375 505 aa21.53■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 DLX3O60479 287 aa21.53■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 CSF2P04141 144 aa21.53■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 PFKFB4Q16877 469 aa21.53■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 PRRT3Q5FWE3 981 aa21.53■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 SYT12Q8IV01 421 aa21.53■■□□□ 1.04
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PSPC1-204ENST00000492741 CCDC126Q96EE4 140 aa21.53■■□□□ 1.04
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PSPC1-204ENST00000492741 ST14Q9Y5Y6 855 aa21.53■■□□□ 1.04
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PSPC1-204ENST00000492741 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.52■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM42Q8IWZ5 723 aa21.52■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.52■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.52■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 C12orf66Q96MD2 445 aa21.52■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 OXSMQ9NWU1 459 aa21.52■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 PDE10AQ9Y233 779 aa21.52■■□□□ 1.04
PSPC1-204ENST00000492741 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
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PSPC1-204ENST00000492741 TRIM13O60858 407 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 ACADLP28330 430 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 HALP42357 657 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ASPHQ12797 758 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 C1orf61Q13536 156 aa21.52■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 LPAL2Q16609 132 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R3AQ16821 1122 aa21.52■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa21.52■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 ARL15Q9NXU5 204 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 NUDT4Q9NZJ9 180 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 TBC1D29Q9UFV1 150 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 WDR37Q9Y2I8 494 aa21.52■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.51■■□□□ 1.03
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