RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 MOB3AQ96BX8 217 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 BICD1Q96G01 975 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD8Q96I13 439 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 MUS81Q96NY9 551 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 SNX7Q9UNH6 387 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-212ENST00000491302 FEZF1A0PJY2 475 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 PRR32B1ATL7 298 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A4O43246 635 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 OR10H2O60403 315 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TUBB2AQ13885 445 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 PACS1Q6VY07 963 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA21Q7Z572 469 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TLK2Q86UE8 772 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TIGD4Q8IY51 512 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 RTP4Q96DX8 246 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 FNBP1Q96RU3 617 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 OSER1Q9NX31 292 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 RNF7Q9UBF6 113 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 GCNT3O95395 438 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TFAP2AP05549 437 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 KRT19P08727 400 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA2P17301 1181 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 NAGLUP54802 743 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 LTBQ06643 244 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MZT1Q08AG7 82 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SNTA1Q13424 505 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 PTK6Q13882 451 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 GRTP1Q5TC63 336 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 LINGO4Q6UY18 593 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SATL1Q86VE3 508 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 COMMD2Q86X83 199 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 GAREM1Q9H706 876 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CLIC2O15247 247 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 PDE9AO76083 593 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 GBAP04062 536 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2-30P06310 120 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A6P31641 620 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MMP15P51511 669 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ASIC2Q16515 512 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 AWAT2Q6E213 333 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CPNE1Q99829 537 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 FZD8Q9H461 694 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MYNNQ9NPC7 610 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JNG1 304 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 HYKKA2RU49 373 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 NEMP2A6NFY4 417 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 LIPFP07098 398 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DOBP13765 273 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MCCP23508 829 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DS5Q14953 304 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A14Q15043 492 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 ODF2Q5BJF6 829 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 LONP2Q86WA8 852 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 MR1Q95460 341 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 HES6Q96HZ4 224 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-212ENST00000491302 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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