RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa16.33■□□□□ 0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASMTP46597 345 aa16.33■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC18A1P54219 525 aa16.33■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERVK-8P63133 956 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOMM20Q15388 145 aa16.31■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLDP09622 509 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLITRK2Q9H156 845 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2AG1Q9H205 316 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 URADA6NGE7 173 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLDN7O95471 211 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFNW1P05000 195 aa16.31■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
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