RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465655.2

RPL39P28-201, Transcript of ribosomal protein L39 pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPL39P28, Length 155 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P28-201ENST00000465655 TLE2Q04725 743 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 CLCQ05315 142 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 GAD2Q05329 585 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 ZP2Q05996 745 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 LRRC63Q05C16 580 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 EGR3Q06889 387 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 FOXM1Q08050 763 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 EHHADHQ08426 723 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 DMWDQ09019 674 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 USP17L24Q0WX57 530 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SREBF2Q12772 1141 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 KCNMA1Q12791 1236 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 TWF1Q12792 350 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 KCNH2Q12809 1159 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 STX4Q12846 297 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 MAP4K2Q12851 820 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 OVGP1Q12889 678 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 NPRL3Q12980 569 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 BNIP2Q12982 314 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 IL24Q13007 206 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 PLA2G7Q13093 441 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 BAMBIQ13145 260 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SLAQ13239 276 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SKP2Q13309 424 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 BIKQ13323 160 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 DGKZQ13574 1117 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 MTMR2Q13614 643 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 CBFBQ13951 182 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SELPLGQ14242 412 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 LRRC32Q14392 662 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 GAS6Q14393 721 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 GCKRQ14397 625 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 CSHL1Q14406 222 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 GRM2Q14416 872 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 GRB14Q14449 540 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 ZNF273Q14593 569 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 KCNJ11Q14654 390 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 CLINT1Q14677 625 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 PTGR1Q14914 329 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 OXA1LQ15070 435 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 RPS6KA2Q15349 733 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SLC9A3R2Q15599 337 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 OR8G1Q15617 311 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 MPPED2Q15777 294 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 CHI3L2Q15782 390 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 ADIPOQQ15848 244 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SLC15A2Q16348 729 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SLC18A3Q16572 532 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 ECM1Q16610 540 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 NRF1Q16656 503 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 MAN2A1Q16706 1144 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 MEP1AQ16819 746 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 PFKFB4Q16877 469 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 FAM187BQ17R55 369 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 IMPG1Q17R60 797 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SLC5A12Q1EHB4 618 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 BMT2Q1RMZ1 405 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 HFEQ30201 348 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 INAVAQ3KP66 663 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 C2orf76Q3KRA6 126 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 USP41Q3LFD5 358 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 MGAT5BQ3V5L5 792 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 RNF212Q495C1 297 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 GALNTL6Q49A17 601 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 VPS26BQ4G0F5 336 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 CTXN3Q4LDR2 81 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 BCL7AQ4VC05 210 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 FLYWCH1Q4VC44 716 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SLC39A12Q504Y0 691 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 PKDCCQ504Y2 493 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 TMEM35AQ53FP2 167 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 KLHL22Q53GT1 634 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 C2CD6Q53TS8 623 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 C2orf27AQ580R0 203 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 SFT2D3Q587I9 215 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 TRIM61Q5EBN2 209 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 ACSBG2Q5FVE4 666 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 NHSL2Q5HYW2 709 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 TEX30Q5JUR7 227 aa0.89□□□□□ -2.27
RPL39P28-201ENST00000465655 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms