RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 ESR1P03372 595 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SHBGP04278 402 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ANXA6P08133 673 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ABHD2P08910 425 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 GIMD1P0DJR0 217 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SAT1P21673 171 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 CCR7P32248 378 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 GP5P40197 560 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 PREPP48147 710 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 CDKN2DP55273 166 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ELOCQ15369 112 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 GRTP1Q5TC63 336 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 XKR5Q6UX68 686 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 GALNT7Q86SF2 657 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 GKN2Q86XP6 184 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SFTPA2Q8IWL1 248 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 EID2Q8N6I1 236 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2L2Q8NH16 312 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ELMO1Q92556 727 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 CPNE1Q99829 537 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 TAAR2Q9P1P5 351 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 GULP1Q9UBP9 304 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 B4DGG1 531 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 E5RI56 91 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 LMO7DNF2Z398 122 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 F8W8V4 182 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 H3BMM5 538 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 QSOX1O00391 747 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM38O00635 465 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHGA12O60330 932 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ERLIN1O75477 346 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 MYF5P13349 255 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 VCLP18206 1134 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 IDSP22304 550 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 AOAHP28039 575 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 GCAP28676 217 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 PDHA2P29803 388 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 MSH2P43246 934 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 CLCNKAP51800 687 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 NAB1Q13506 487 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 BMPR2Q13873 1038 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 LRP8Q14114 963 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 MAP9Q49MG5 647 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 METRNLQ641Q3 311 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 PIM3Q86V86 326 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 HM13Q8TCT9 377 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 PATE1Q8WXA2 126 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB9Q96C00 473 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 VPS39Q96JC1 886 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 PANX3Q96QZ0 392 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 PAFAH2Q99487 392 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR21Q99679 349 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 RBBP8Q99708 897 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 OLFM1Q99784 485 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 WWP1Q9H0M0 922 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 RHOJQ9H4E5 214 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 COG4Q9H9E3 785 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 MED16Q9Y2X0 877 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-208ENST00000463533 VWA7Q9Y334 891 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms