RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 RHDQ02161 417 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC12A1Q13621 1099 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRKG1Q13976 671 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTK2BQ14289 1009 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SQLEQ14534 574 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM132DQ14C87 1099 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZBED5Q49AG3 693 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 COQ5Q5HYK3 327 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MDH1BQ5I0G3 518 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 COLEC12Q5KU26 742 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SYCP2LQ5T4T6 812 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRT80Q6KB66 452 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NPNTQ6UXI9 565 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 RFX8Q6ZV50 586 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPR141Q7Z602 305 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GALNT7Q86SF2 657 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LINC00523Q86TU6 105 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SNX32Q86XE0 403 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ERO1BQ86YB8 467 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CNTN4Q8IWV2 1026 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRC52Q8N7C0 313 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKFN1Q8N957 763 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SMYD1Q8NB12 490 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNF149Q8NC42 400 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LEMD2Q8NC56 503 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDPRQ8NCN5 879 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM45AQ8TCE6 357 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 URGCPQ8TCY9 931 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARNTL2Q8WYA1 636 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC9A6Q92581 669 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 BORCS5Q969J3 196 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 EME1Q96AY2 570 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ROPN1LQ96C74 230 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 HPDLQ96IR7 371 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLMNQ96JQ2 1002 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CSPG4P5Q96PW8 444 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GCNAQ96QF7 691 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDRT15Q96T59 188 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPR22Q99680 433 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCT7Q99832 543 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC25A23Q9BV35 468 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FTHL17Q9BXU8 183 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDT1Q9H211 546 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 RHOJQ9H4E5 214 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PREBQ9HCU5 417 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CASS4Q9NQ75 786 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM140Q9NV12 185 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 PNPOQ9NVS9 261 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 HOXC10Q9NYD6 342 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 RRN3Q9NYV6 651 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 GGA3Q9NZ52 723 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLIC5Q9NZA1 410 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-55P-201ENST00000411092 TLK1Q9UKI8 766 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms