RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410466.1

RNU6-554P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 554, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-554P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-554P-201ENST00000410466 NR1D2Q14995 579 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 USP41Q3LFD5 358 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SYT13Q7L8C5 426 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 TDRPQ86YL5 185 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 TMEM61Q8N0U2 210 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC5A8Q8N695 610 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 L3MBTL4Q8NA19 623 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 USP38Q8NB14 1042 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 LINS1Q8NG48 757 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 BRI3BPQ8WY22 251 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 MUL1Q969V5 352 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SH3KBP1Q96B97 665 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 GCC1Q96CN9 775 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 EPHX3Q9H6B9 360 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 PLEKHA3Q9HB20 300 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 ACKR4Q9NPB9 350 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 Q9UF83 564 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 PCNX2A6NKB5 2137 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 A0A1W2PN81 502 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 AQP12BA6NM10 295 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 M0QZ24 198 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF861PO60384 105 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 FGF18O76093 207 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 ACTL6AO96019 429 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 RENP00797 406 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 TFP02787 698 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 H1F0P07305 194 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 UMPSP11172 480 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 ATF3P18847 181 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 CHRNA7P36544 502 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 RAB27AP51159 221 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 ATP4BP51164 291 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 PFN3P60673 137 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 MCL1Q07820 350 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 PLA2G7Q13093 441 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 PPP2R5BQ15173 497 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 KLHL26Q53HC5 615 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 LRRC31Q6UY01 552 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 QSOX2Q6ZRP7 698 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 OAFQ86UD1 273 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 C4orf32Q8N8J7 132 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SCAMP5Q8TAC9 235 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 GATAD1Q8WUU5 269 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 MAGEB18Q96M61 343 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 NECTIN4Q96NY8 510 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 EYA3Q99504 573 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SEMA3CQ99985 751 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 PCGF1Q9BSM1 259 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 DEFB126Q9BYW3 111 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 LRRCC1Q9C099 1032 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 VNN3Q9NY84 501 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 KIAA1456Q9P272 454 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SUFUQ9UMX1 484 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 TMCC2O75069 709 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 ALDH1L1O75891 902 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 FAM155BO75949 473 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 KRT38O76015 456 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SEC24AO95486 1093 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 HEXAP06865 529 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 PSG2P11465 335 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 TNFAIP3P21580 790 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 GDF1P27539 372 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 HOXC9P31274 260 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 PTGDSP41222 190 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 HSPA7P48741 367 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 MCM2P49736 904 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 LY6EQ16553 131 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SPECC1Q5M775 1068 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 OLFM4Q6UX06 510 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 TMUB2Q71RG4 321 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 RRAGAQ7L523 313 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZER1Q7Z7L7 766 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 HIPK1Q86Z02 1210 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 TMEM57Q8N5G2 664 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 STYXQ8WUJ0 223 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 OVOL2Q9BRP0 275 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-554P-201ENST00000410466 SIL1Q9H173 461 aa0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms