RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 ERLIN1O75477 346 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 FTH1P02794 183 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ESR1P03372 595 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 FMO4P31512 558 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 SLC19A1P41440 591 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PPM1NQ8N819 430 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 HAUS5O94927 633 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 C1QAP02745 245 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CD1CP29017 333 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 GABREP78334 506 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 SQSTM1Q13501 440 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 BRD3Q15059 726 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 C3orf38Q5JPI3 329 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 LSMEM2Q8N112 164 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 MDM1Q8TC05 714 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PANX3Q96QZ0 392 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CPNE1Q99829 537 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 NUDT22Q9BRQ3 303 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 WWP1Q9H0M0 922 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 COG4Q9H9E3 785 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 RDH14Q9HBH5 336 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.31■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 IGF2RP11717 2491 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PIAS1O75925 651 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 AHSGP02765 367 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CSF2RBP32927 897 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 GP5P40197 560 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 MAPK9P45984 424 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 LSSP48449 732 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CYP4F3Q08477 520 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 RPA4Q13156 261 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CLCA4Q14CN2 919 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 RPE65Q16518 533 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PHF19Q5T6S3 580 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CNSTQ6PJW8 725 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 USP53Q70EK8 1073 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM159Q96B96 161 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 BIRC8Q96P09 236 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 SATB2Q9UPW6 733 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PSAT1Q9Y617 370 aa20.3■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 MPOP05164 745 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 GABRB3P28472 473 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 SLC29A2Q14542 456 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ST3GAL2Q16842 350 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 C12orf66Q96MD2 445 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 RHOJQ9H4E5 214 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.29■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 FRYQ5TBA9 3013 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC151A5D8V7 595 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 E5RI56 91 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 BRINP1O60477 761 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 HSD17B3P37058 310 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 GPR18Q14330 331 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 SYTL3Q4VX76 610 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 GRTP1Q5TC63 336 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PROSER1Q86XN7 944 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 GPATCH11Q8N954 259 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ELMO1Q92556 727 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms